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2025年2月17日范衡宇实验室在Science Bulletin发文揭示DExD/H-box家族成员DHX36介导的核酸G-四链体解旋在维持哺乳动物卵母细胞染色质构象和RNA稳态中的重要作用

时间:2025年02月19日 访问次数:152

  我院范衡宇课题组于Science Bulletin杂志在线发表题为DHX36-mediated G-quadruplexes unwinding is essential for oocyte and early embryo development in mice的研究长文。该研究首次发现哺乳动物卵母细胞和早期胚胎发育过程中G-四链体(G-quadruplex, G4)结构的形成与DHX36的分布具有时空一致性,揭示了DHX36参与结合与解开DNApre-rRNA上的G4结构,参与调控染色质构象、基因转录和pre-rRNA剪切加工等过程,从而维持哺乳动物雌性生殖过程中的排卵、卵子成熟与早期胚胎发育等功能。

 


        G4是由富含鸟嘌呤的DNARNA序列通过四个鸟嘌呤之间的Hoogsteen氢键配对形成的特殊核酸二级结构 [1]此前,DHX36 (又名RHAU被报道为一种从人类细胞裂解液中捕获和纯化的G4解旋 [2]。已有研究表明,DHX36通过解开G4结构,参与细胞内转录转录后过程,在精子发生和心脏发育 [34] 等生理过程中发挥重要作用。然而,DHX36哺乳动物卵子和早期胚胎发育中的功能尚不明确

  研究团队首先利用条件性敲除(CKO)小鼠模型,揭示了DHX36缺失对于雌性生殖过程中的激素响应、排卵、卵母细胞成熟早期胚胎发育造成的严重影响进一步,研究者发现DHX36缺失导致卵母细胞染色质构象异常,伴随着染色质开放性的显著降低。其中,核仁类似体(Nucleolus-like Body, NLB)结构体积明显增加,异染色质凝集斑块明显缩小,且多种组蛋白修饰(H3K4me3, H3K9me3H3K27me3)水平显著降低。ATAC-Seq进一步揭示,虽然整体染色质开放性在转录起始位点(TSS)和rDNA编码区域显著降低,但是G4基序(G4 motif)却在显著富集。同时,RNA-seq揭示了DHX36在维持母源转录本稳态中的功能。

  此外,研究者发现pre-rRNA的转录和加工过程也受到了严重影响。具体而言,DHX36缺失导致pre-rRNA水平在生长早期的卵母细胞(Growing Oocytes, GO)中表达不足,在生长晚期的卵母细胞(Fully-grown Oocytes, FGO)中异常累积,并伴随着细胞中整体翻译活性的显著下降。进一步,研究者使用小分子荧光探针和G4抗体,发现G4结构在DHX36敲除的卵母细胞核中显著累积。有意思的是,DHX36在卵母细胞和早期胚胎发育的各个阶段特异性地富集在rDNApre-rRNA富集在核仁相关结构中。体外实验表明,DHX36蛋白能够特异性地与rDNA G4序列以及pre-rRNA结合。外源过表达的DHX36蛋白能够强力地结合在卵母细胞的核仁相关区域,并且一定程度上减轻pre-rRNA在敲除卵母细胞中的累积

  该研究首次揭示了DHX36在卵子质量维持和雌性生育力保护过程中的关键作用及潜在机制这一过程主要涉及DHX36蛋白作为G4解旋酶参与DNA G4结构RNA G4结构的解旋临床上不孕不育女性卵子质量研究提供重要参考。

 

1DHX36在小鼠卵母细胞中通过调控DNA/RNA G4结构的解旋从而参与染色质构象和rRNA前体的加工过程。

 

  我院范衡宇课题组的博士研究生焦宇萱为本文第一作者。课题组成员布国伟博士、陈宝宝博士、吴韵雯博士(已毕业)、博士研究生吴雨珂为该研究提供了帮助。广东工业大学卢宇靖教授及课题组成员也对本研究提供了大力支持。该研究获得了国家重点研发计划项目、国家自然科学基金、浙江省自然科学基金项目和浙江省重点研发计划等项目资助。

 

  原文链接:https://doi.org/10.1016/j.scib.2025.02.017

 

  参考文献:

[1] Spiegel J, Adhikari S, Balasubramanian S. The structure and function of DNA G-quadruplexes. Trends Chem 2020; 2:123-136.

[2] Vaughn JP, Creacy SD, Routh ED et al. The DEXH protein product of the DHX36 gene is the major source of tetramolecular quadruplex G4-DNA resolving activity in HeLa cell lysates. J Biol Chem. 2005; 280:38117-38120.

[3] Zhang K, Zhang T, Zhang Y et al. DNA/RNA helicase DHX36 is required for late stages of spermatogenesis. J Mol Cell Biol 2023; 14:mjac069.

[4] Nie J, Jiang M, Zhang X et al. Post-transcriptional regulation of Nkx2-5 by RHAU in heart development. Cell Rep 2015; 13:723-732.